I farmaci immunosoppressori possono essere utilizzati in patologie mediate da risposte Th1 o da risposte Th2. Patologie Th1 sono: artrite reumatoide, lupus eritematoso, sclerosi multipla, rigetto di trapianti, diabete. Patologie Th2 sono: asma bronchiale, BPCO (in parte) che prevedono la produzione di anticorpi della classe IgE.